Die Auseinandersetzungen der Arbeitsgruppe mit ethischen Fragen der Gentechnologie sind zumeist in Form einer ethischen Erörterung zu einer umschriebenen Fragestellung: So wurden Aspekte der Regulierung prädiktiver genetischer Tests (Gendiagnostik in Deutschland, 2007), die ethischen Dimensionen der Stammzellforschung unter den Gesichtspunkten der Menschenwürde und Forschungsfreiheit (Stammzellforschung uns Zelltherapie, 2006) oder ethische Fragen zum Keimbahneingriff im Kontext der Gentherapie (Gentherapie in Deutschland, 2009) diskutiert.

Kontroversen wurden dabei entweder in Gegenüberstellung von Positionen (Grüne Gentechnik, 2007) oder durch Rekonstruktion historischer Entwicklungslinien und systematischer Argumentationszusammenhänge (Stammzellforschung und Zelltherapie, 2006) dargelegt.

Im "Zweiten Gentechnologiebericht" (2009) wurde ein anderer Weg gewählt: Um der ursprünglichen Idee des Gentechnologieberichtes nachzukommen, nämlich ein Observatorium für die Gentechnologie insgesamt darzustellen, ist hier einer zentralen Frage nachgegengen worden: Welche grundsätzlichen Betrachtungsweisen und Standpunkte strukturieren die mannigfachen ethischen Diskurse um die vielfältigen mit der Gentechnologie verbundenen Handlungsoptionen?

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• Zweiter Gentechnologiebericht (2009), S. 383 ff.